Каменный храм Иоанна Богослова с зимним приделом во имя Святителя и Чудотворца Николая вместо старой обветшавшей церкви был выстроен в с. Стебачёво в 1786 году на средства прихожан. В XIX веке к трапезной с западной стороны была сделана пристройка.
Никогда не закрывался, даже в самые безбожные времена.
Храм известен тем, что здесь служили прапрадед Пётр, прадед Василий и дед Владимир русской поэтессы Серебряного века Марины Цветаевой. Во время ремонтных работ 1988 года была найдена медная пластина — поминальная доска, на которой было указано около 40 имён из рода Цветаевых.